普陀少年科学院成立于2001年11月。它以组织少年院士开展科技教育活动提高少年院士的组织能力、科研能力和科技传播能力，培养有科学精神和创新能力的优秀学生，推动全区青少年的科技活动的开展为宗旨。聘请了9位教授级的专家组成员，其中2位为中科院院士；9位由特级教师、高级教师组成的导师团成员。在全区共评出第一批小院士37人，第二批小院士29人；下设曹杨二中分院和江宁学校分院。